C'est en octobre 1869 que l'Infirmerie des Pâquis ouvre ses portes. Jusqu'alors, les hôpitaux ou hospices recevaient essentiellement les pauvres, les invalides, les contagieux, les vagabonds... ceux que la société rejetait. L'Infirmerie des Pâquis, dotée à sa création de 9 lits d'adultes et de 3 lits d'enfants, s'inscrit immédiatement dans l'évolution de la médecine au XIXe siècle, puisqu'elle y reçoit des malades « curables », pour lesquels les soins à domicile sont impossibles ou insuffisants. Il faut relever qu'à cette époque, l'espérance de vie à la naissance est légèrement supérieure à 40 ans. La mortalité infantile enlevait un cinquième des enfants avant leur premier anniversaire, un quart avant dix ans.

Dès la dernière décennie du XIXe siècle, les soignants sont confrontés à des préoccupations appelées à devenir récurrentes. Une augmentation du nombre des malades marque cette fin de siècle, alors que 3 lits sont supprimés à l'Infirmerie lors de la création de la salle d'opération. 25 lits supplémentaires sont apportés par la construction d'un nouveau bâtiment, inauguré en novembre 1897. Par la suite, l'augmentation de la durée de séjour des patients requiert encore de nouveaux agrandissements. Un nouveau bâtiment agrandi à 95 lits est ainsi mis en fonction en juin 1949. Conforme aux meilleurs hôpitaux du canton, l'Infirmerie portera dès lors le nom d'Hôpital.

Dès 1956 déjà se pose la question de construire un nouvel hôpital à Morges pouvant accueillir une population toujours croissante, au lieu d'effectuer encore de coûteuses transformations dans le bâtiment de l'Avenue des Pâquis. Après de nombreuses péripéties, le programme du Nouvel Hôpital de Zone, l'étude de sa gestion, l'avant-projet architectural et l'étude financière du projet sont présentés en 1968 aux organes compétents de l'Etat.

L'hôpital de zone de Morges est inauguré en janvier 1973 à son emplacement actuel. Aujourd'hui, c'est un centre de santé ouvert à tous qui fonctionne 24 h sur 24 et accueille toutes les classes sociales de la naissance au décès.

Mais l'histoire ne s'arrête pas là. L'augmentation de son activité est telle qu'un nouvel agrandissement est mis en route en août 2005, principalement pour permettre de désengorger le Service des Urgences. En effet, ce service travaille dans les mêmes infrastructures qu'en 1973 alors que son activité a doublé ne serait-ce que durant les 20 dernières années. Les nouvelles Urgences, qui portent la capacité totale de l'Hôpital à 220 lit, sont mises en service le 6 décembre 2006. L'événement est marqué par un week-end de festivités les 16 et 17 mai 2008.